麦克将孢子群送上了太空船，孢子群十分高兴，请麦克有机会到太空去作客。麦克挥舞双手，目送着运载火箭在轰鸣声中拔地而起， 冲向大空……。
清晨，麦克和一条被他抢救过来的海豚在大海中嬉戏。 伊丽莎白请人把他叫回了潜艇。原来，在夏威夷的西南面发现异常现象。情报部门怀疑又是舒拔在捣鬼。
麦克和伊丽莎白乘坐“海鲸号”来到了电波异常海域。 麦克游出潜艇到海底探索。伊丽莎白从监视器的显示屏上，看到舒拔的微型潜艇正跟踪着麦克，急于想把这个情况告诉麦克，但因通讯干扰，无法与麦克联络。
舒拔跟踪麦克的目的是为了寻找海底“水晶世界”的入口。只要找到水晶，井把它放到卫星上，就可以使全世界的 广播通讯都中断。那时，全世界都得向他舒拔求救了。
麦克顺着一个大旋涡钻进海底，一下进入了一个奇妙的“水晶世界”。当他向那些大眼睛、小嘴巴、身材矮小的异型人了解当地情况时，被受惊吓的异形人击晕了过去。等他睁眼醒来时，已被异形人控制在了神坛上。异形人认为，麦克是来破坏“水晶世界”的，便用水晶球拷问他。麦克忍痛解释说：“我到这里是来找舒拔的，他是一个危险份子，会给你们带来灾难的。”但异形人说什么也不信，继续拷打他。
舒拔的小型潜艇跟着麦克也进了“水晶世界”。舒拔从身上掏出一支钢笔大小的紫外线发生器，对随从们说：“海底生物怕紫外线，我这紫外线发生器，可以随心所欲地叫他们给我采集我所需要的水晶。”
不多一会儿，舒拔他们就找到了异形人和被异形人控制着的麦克。舒拔用他的紫外线发生器制服了异形人，逼迫异形人为他采掘水晶。麦克为伺机逃走，就假装他的眼睛也被紫外线照射失明了，使舒拔一伙放松了对他的监视。一个给麦克送饭来的异形人，悄悄地告诉麦克：“神坛下有个地洞，进入地洞后找到一个喷水的池子，就可逃到大海里了。”
麦克偷偷地从地洞中逃了出去，等到舒拔发现追赶已来不及了。
“海鲸号”上，伊丽莎白从麦克带回的那块水晶上得到启发，请海军部扣押了准备接应舒拔的潜艇，使舒拔无法将采集到的水晶运出海底。
舒拔见无路可走，自叹不是麦克的对手，只得乖乖地向麦克投降。
凯旋返航的“海鲸号”载着麦克和伊丽莎白，迎着朝阳， 劈波斩浪，乘胜前进……。
